Tem como principais projetos "Estudos sobre os Sistemas Toxina-Antitoxina Bacterianos", em especial de Leptospira interrogans, e "Expressão de Proteínas Recombinantes de Importância Biotecnológica como Interferon Humano em E. coli". Atua principalmente na área de Química de Proteínas e Biologia Molecular: caracterização química e funcional de proteínas plasmáticas e recombinantes, enzimologia, purificação de proteínas, clonagem, expressão gênica, desenvolvimento de vacinas e estudos funcionais de proteínas de sistemas toxina-antitoxina.

Os sistemas TA são elementos de adaptação a condições de estresse e são distribuídos amplamente nos genomas bacterianos. Eles podem provocar interrupção do crescimento, formação de células persistentes e morte celular, e têm sido associados ao processo de infecção em diversas bactérias patogênicas. Os sistemas TA (Tipo II) codificam duas proteínas, a toxina estável (VapC e MazF) e a antitoxina instável (VapB e MazE). A toxina é classificada por meio da homologia de sequência e função.  Nosso interesse reside na caracterização dos módulos TA de Leptospira das famílias VapBC e MazEF para estudos funcionais e de patogenicidade.

1. Pós-Graduação Interunidades em Biotecnologia– USP-IB-IPT
2. Biotecnologia e Bioprocessos – Instituto Butantan

1. “Revisiting the Development of Vaccines Against Pathogenic Leptospira: Innovative Approaches, Present Challenges, and Future Perspectives.” Barazzone, G.C., Teixeira, A.F., Azevedo, B.O.P., Damiano, D.K., Oliveira, M.P., Nascimento, A.L.T.O, and Lopes A.P.Y. (2022). Frontiers in Immunology, v. 12, p. 760291, 2022. doi.org/10.3389/fimmu.2021.760291
2. “The VapBC-4 Characterization Indicates It Is a Bona Fide Toxin-Antitoxin Module of Leptospira interrogans: Initial Evidence for a Role in Bacterial Adaptation”. Azevedo, B.O.P., Damiano, D.K., Teixeira, A.F., Nascimento, A.L.T.O, Fernandes, L.G.V., and Lopes A.P.Y. Microorganisms v. 13, p. 879, 2025. DOI: 10.3390/microorganisms13040879
3. “In silico analysis of genetic VapC profiles from the toxin-antitoxin type II VapBC modules among pathogenic, intermediate and non-pathogenic Leptospira.” Lopes, A. P. Y.*, Azevedo, B. O. P., Emidio; R. C., Damiano, D. K., Nascimento, A. L. T. O. and  Barazzone, G. C. (2019). Microorganisms 7(56): 1-18. doi:10.3390/microorganisms7020056.
4. VapC from the Leptospiral VapBC Toxin-Antitoxin Module Displays Ribonuclease Activity on the Initiator tRNA. Lopes A. P. Y.*, Lopes, L. M., Fraga, T. R., Chura-Chambi, R. M., Sanson, A. L., Cheng, E., Nakajima, E., Morganti, L. & Martins, E. A. L. (2014). Plos One 9: e101678. Microorganisms. microorganisms-446339
5. Influence of the mRNA initial region on protein production: a case study using recombinant detoxified pneumolysin as a model. Fusco, F., Pires, M. C., Lopes, A. P. Y., Alves, V. S., Gonçalves, V. M. (2024). Frontiers in Bioengineering and Biotechnology 11. Doi: 10.3389/fbioe.2023.1304965.

Atuais

Egressos

Projeto de Pesquisa Regular FAPESP - 2018/05823-9 (2019-2023) - Coordenador. Título: “Estudo dos Sistemas Toxina-Antitoxina VapBC de Leptospira interrogans: Bioquímica, Função e Participação na Fisiologia do Estresse Bacteriano”.