Carla Lima Da Silva

Cargo: Pesquisadora científica

Laboratório: Laboratório de Toxinologia Aplicada

Linha de pesquisa: toxinas de peixes peçonhentos como ferramentas moleculares para o estudo dos mecanismos subjacentes aos processos inflamatórios

Contato: (11) 2627-9733 (escritório) / 3757 (secretaria) | carla.lima@butantan.gov.br

 

Links

Formada em Farmácia (UFJF) com especialização em Indústria, minha trajetória acadêmica foi consolidada com um Doutorado em Imunologia e um Pós-Doutorado em Farmacologia pela USP de São Paulo. Desde 2004, atuo como pesquisadora no Laboratório de Toxinologia Aplicada (LETA) do Instituto Butantan, onde exerci a vice-diretoria entre 2015 e 2019 e sou responsável-adjunta da Plataforma Zebrafish desde 2015. Minha experiência integra pesquisa translacional de ponta e gestão científica. Na gestão pública, liderei o planejamento, captação e uso racional de recursos para projetos em Imunologia, Farmacologia e Toxicologia, otimizando a tomada de decisões e agilizando processos de pesquisa. No laboratório, conduzo uma linha de investigação inovadora que utiliza toxinas de peixes peçonhentos como ferramentas moleculares e o modelo alternativo do zebrafish para desvendar os mecanismos dos processos inflamatórios. Atualmente, meu foco está no potencial translacional da proteína Natterina, investigando-a como uma nova reguladora chave da ativação do inflamassoma. Minha missão é traduzir a excelência da pesquisa básica em aplicações práticas, combinando gestão eficiente de projetos e metodologias inovadoras para formar novas gerações de cientistas e acelerar o desenvolvimento de soluções para a saúde.

 

O principal foco de minha linha de pesquisa é usar toxinas de peixes peçonhentos como ferramentas moleculares para o estudo dos mecanismos subjacentes aos processos inflamatórios, recapitulando em embriões de zebrafish processos inflamatórios imunomediados.

Teleósteos como modelo para estudar ligantes e receptores importantes envolvidos na resposta imune têm sido utilizados para identificar características que são conservadas evolutivamente. A robustez da sua resposta imune inata e adaptativa, reconhecendo e erradicando todas as classes de patógenos presentes em ambientes ecologicamente divergentes, certamente contribuiu para o grande número de espécies neste grupo. Embora um grande conhecimento sobre o inflamassoma tenha sido obtido em um modelo murino, o zebrafish pode oferecer uma perspectiva evolutiva sobre componentes e conceitos que são altamente conservados. Descobertas recentes destacaram a existência de receptores típicos ou moléculas de teleósteos necessárias para interagir como interface entre receptores de reconhecimento de padrões e receptores do complexo inflamassoma. Natterinas são proteínas formadoras de poros que foram descobertas no veneno do peixe de importância médica Thalassophryne nattereri. Em vertebrados, homólogos de natterina ou natterina-like estão abundantemente presentes em 109 peixes, incluindo zebrafish os quais foram descritos como moléculas imunes efetoras. Dada a sua conservação evolutiva, sua ampla expressão em tecidos envolvidos na imunidade contra infecções e também seu papel fundamental no desenvolvimento, nós consideramos a hipótese de que membros da família Natterina podem estar envolvidos na co-regulação da ativação inflamassoma.

Trabalhamos na Plataforma Zebrafish e utilizamos embriões de zebrafish como modelo organismo alternativo em linha com a filosofia 3Rs (redução, refinamento e substituição). Além do biotério de zebrafish, a Plataforma dispõe para a execução projetos de pesquisa e inovação de laboratórios integrados e técnicos com alta especialização técnica em métodos de cultivo, modelo in vivo de doenças ou de inflamação e infecção em larvas de zebrafish, purificação e analise citometrica celular; edição genica por Morfolino, CRISPR/Cas9, superexpressão (mRNA sintéticos), análises dos transcritos por hibridização in situ/whole-mount e RT-PCR quantitativo e de proteínas por Western Blot e ELISA, imunolocalização por imunofluorescência e imunohistoquímica, dinâmica celular por microscopia intravital, testes toxicológicos como FET Tests, cardiotoxicidade, teratogenicidade, neurotoxicidade e metabólicos como nefrotoxicidade e hepatotocicidade, testes do perfil comportamental de larvas como preferência claro/escuro, resposta de alarme e resposta visual motora.

PPGTox do Instituto Butantan

  1. Pinto FJ, Gusso D, Bernardo JTG, Andrade-Barros AI, DeOcesano-Pereira C, Lopes-Ferreira M, Lima C. Natterin-mediated NLRP3 inflammasome activation in zebrafish: evolutionary insights and aquaculture implications. Fish Shellfish Immunol. 2025 Oct;165:110508. doi: 10.1016/j.fsi.2025.110508. Epub 2025 Jun 19. PMID: 40543766.
  1. Gusso D, Pinto FJ, Andrade-Barros AI, Bernardo JTG, DeOcesano-Pereira C, Lopes-Ferreira M, Lima C. Natterin Bridges IFN-φ1 and Non-canonical Inflammasome Pathways via CRFB1/Gbp4 to License Caspy2-Mediated Antibacterial Immunity. Front. Cell. Infect. Microbiol. 15:1686758.2025. doi: 10.3389/fcimb.2025.1686758.
  1. Seni-Silva AC, Maleski ALA, Souza MM, Falcao MAP, Disner GR, Lopes-Ferreira M, and Lima C. Natterin-like depletion by CRISPR/Cas9 impairs zebrafish (Danio rerio) embryonic development. BMC Genomics. 2022, 23(1): 123. 10.1186/s12864-022-08369-z
  1. Maleski ALA, Rosa JGS, Bernardo JTG, Astray RM, Walker CIB, Lopes-Ferreira M, Lima C. Recapitulation of Retinal Damage in Zebrafish Larvae Infected with Zika Virus. Cells. 2022 Apr 26;11(9):1457. doi: 10.3390/cells11091457.

 

  1. Lima C; Disner GR; Falcão MAP; Seni-Silva AC; Maleski ALA; Souza MM; Tonello MCR; Lopes-Ferreira M. The Natterin protein family diversity: a review on phylogeny, structure, and immune function. Toxins, 2021 13, 538. doi: 10.3390/toxins13080538

Atuais

Manuela Jacobina de Sá. Bolsista Iniciação Científica Fapesp (2025/09570-1) - Instituto Butantan

Felipe Justiniano Pinto. Bolsista Doutorado Fapesp (2024/16448-5) - PPGTox do Instituto Butantan

Darlan Gusso, Bolsista Pós-Doc Fapesp (2023/10147-0). Instituto Butantan. 


 

Egressos

Lidiane Zito Grund

Evilin Naname Komegae

Edson Kiyotaka Ishizuka

Ana Carolina de Seni Silva

Aline Ingrid Andrade de Barros

 

Em andamento

1. Os membros da Família Natterina em zebrafish são capazes de interagir com sensores citosólicos e ativar o inflamassoma?

Processo: 2024/01076-5

Linha de fomento: Auxílio Regular Fapesp

Vigência: 01 de Novembro de 2024 a 31 de Outubro de 2026

 

2. Center for Toxins, Immune Response, and Cell Signaling (CeTICS).

Linha de fomento: Auxilio Pesquisa CEPID

Agência Financiadora: FAPESP Processo: 2013/07467-1

Vigência: 01/07/2013 a 30/06/2025


 

Concluídos

Avaliação da importância funcional de proteínas da família Natterin na ativação do inflamassoma em zebrafish

Processo: 21/06084-8

Linha de fomento: Auxílio à Pesquisa - Regular

Vigência: 01 de dezembro de 2021 - 30 de novembro de 2023

 

Avaliação do papel do inflamassoma na inflamação neutrofílica induzida por toxinas formadoras de poros, Natterinas

Processo: 18/17413-0

Linha de fomento: Auxílio à Pesquisa - Regular

Vigência: 01 de março de 2019 - 29 de fevereiro de 2020

 

A549; BEA5-2B; CCL-228 (SW480 - GM-CSF); CCL-34 (MDCK); CRL-1730; CRL-1772 (C2C12); HeLa; J558L (GM-CSF); L929 (M-CSF); NCIH292; R46A2 (anti-IFN-γ); WEHI-3 (IL-3)

1. Valerie F. Quesniaux e Bernhard Ryffel da Experimental Allergy and Immunology Unit of the Lung Inflammation Laboratory of the Transgenose Institute. CNRS em Orleans na França

2. Richard Harris do Australian Institute of Marine Science

3. Christine Hafner, Heimo Breiteneder e Tanja Kalic do Institute of Pathophysiology and Allergy Research, Center for Pathophysiology, Infectiology and Immunology, Medical University of Vienna, Vienna, Austria

 

Entrevistas

Veneno de peixe: a pesquisa do Butantan que foi revisada por crianças. BBC News, p. 1, 01 ago. 2023. Lima, C.; Lopes-Ferreira, M.; Disner, GR and Biernath A.