Minha linha de pesquisa, concentra-se em investigar os ciclos reprodutivos de serpentes e lagartos, bem como a evolução das estratégias reprodutivas (e.g., estocagem de esperma e modo reprodutivo (ovíparo/ vivíparo). Em comportamento animal estudo as interações sociais durante a época reprodutiva (lutas e rituais de combate entre machos e agregações para acasalamento). Atualmente emprego técnicas de reprodução assistida (ultrassonografia, avaliação do sêmen e inseminação artificial) para manejo e preservação de espécies ameaçadas. Os projetos em que atuo visam viabilizar o uso de técnicas de manipulação e processamento de sêmen para o manejo e conservação ex situ de cinco espécies de jararacas endêmicas de ilhas do sudeste do Brasil: Bothrops alcatraz, B. germanoi, B. insularis, B. otavioi e B. sazimai. Especificamente, caracterizamos os parâmetros do sêmen e avaliamos a sua viabilidade, e faremos correlações com características biométricas e variações sazonais, durante o ciclo reprodutivo de 
cada espécie.

• MIGLIORE, S. N.; BRAZ, H. B. GASPAROTTO, V. P. O.; LISBOA, C. S.; DIAS, R.,  ARAÚJO, G.; RAMALHO, R. A.; ALMEIDA-SANTOS, SELMA M. Reproductive strategies of the most geographically isolated Trachylepis support predictions of the island syndrome. Scientific Reports, 2026
• BARROS VA; ROJAS, CA; ALMEIDA SANTOS, SM. Biologia Reprodutiva das Serpentes Jararacas: Ciclos e comportamentos, dimorfismo e maturidade sexual. Novas Edições Acadêmicas, 2020. 180 p. Esse é o primeiro livro de reprodução de serpentes em português, que aborda todos os tópicos e eventos reprodutivos, que são importantes para quem inicia estudos sobre o tema. Esse trabalho surgiu da supervisão de um pós-doutorado da Verônica A. Barros e de doutorado de Claudio A. Rojas. 
• KASPEROVICZUS, KN; BRAZ, HBP; AMORIM, LGS; ALMEIDA-SANTOS, SM.  Reproductive Strategies of the Golden Lancehead, Bothrops insularis, from Queimada Grande Island: Constraints and Challenges. In: Lillywhite HB; Martins M. (Org.). Islands and Snakes - Diversity and Conservation. New York: Oxford University Press, 2023, v. 2, p. 55-66. Esse capítulo de livro descreve os desafios e as restrições reprodutivas de B. insularis, serpente endêmica da Ilha da Queimada Grande, que depende de pássaros migratórios para a sua dieta, e dessa forma, desenvolver condições reprodutivas gonadais, para os eventos de corte e acasalamentos sazonais.
• BRAZ HB; ALMEIDA-SANTOS SM. The Evolution of Sperm Storage location in Squamata with References to Snakes. In: Gower DJ; Zaher H. (Org.). The Origin and Early Evolutionary History of Snakes. Cambridge: Cambridge University Press, 2022, p. 390-409. Esse capítulo mostra a estocagem de esperma, como um componente obrigatório de ciclos dissociados de serpentes e lagartos, enfatizando, como a locação das regiões de estocagem de esperma, podem ter evoluído nos grupos mais basais aos mais derivados. 
• ALMEIDA-SANTOS SM; SALOMÃO MG. Long Term Sperm storage in the Female Neotropical Rattlesnake Crotalus durissus terrificus (Viperidae: Crotalidae). Japanese Journal of Herpetology, v. 17, p. 46-52, 1997. Esse manuscrito, se refere ao mecanismo singular de estocagem de esperma em cascavéis, em que uma contração uterina na junção útero-vaginal, denominado UMT, permite a estocagem de esperma, concentrada nessa região, até a fertilização, que ocorre em condições favoráveis para as fêmeas.   

• Professor do Programa de Pós-Graduação em Anatomia - FMVZ – USP.
• Professor do Programa de Pós-Graduação em Biodiversidade -Universidade UNESP- São José do Rio Preto. 
• Professor do Programa de Pós-Graduação em Zoologia - Instituto de Biociências – USP.

Orientações de Mestrado e Doutorado (quantitativo):

1) Dissertações de Mestrado
a) orientadas e já defendidas: 34
b) em andamento: 02

2) Teses de Doutorado:
a) orientadas e já defendidas: 21
b) em andamento: 04

3) Supervisões de Pós-Doutorado
a) concluídas: 03
b) em andamento: 01
 

Mestrado, Doutorado e Pós-doutorado (internacional)

• Ximena López Goñi. Ciclos reprodutivos de Geophis brachycephalus e Geophis godmani em Las Nubes de Coronado, Costa Rica. Programa de Mestrado em Biologia - Universidade da Costa Rica, 2025. 
• Rafaela Coeti Doutorado (Dupla titulação CAPES),  na Universidade de La Frontera (Chile). COETI RZ; ANTONIAZZI MM; SÁNCHEZ R; ALMEIDA-SANTOS SM. Sperm storage in coral snakes: a spermatozoa ultrastructural approach (Serpentes: Elapidae). Zoologischer Anzeiger, v. 290, p. 49-57, 2021. 
• Karina Pereira da Silva, doutorado Sanduíche (CAPES), no Instituto Clodomiro Picado (Costa Rica). Biologia reprodutiva de Bothrops asper, em colaboração com o Dr. Mahmood Sasa. SILVA KMP; ALMEIDA-SANTOS SM; BRAVO-VEGA CA; SASA M. Sexual maturity of the Central American lancehead Bothrops asper (Serpentes: Viperidae). Phyllomedusa, v. 22, P. 75-80, 2023.
• Henrique Bartolomeu Braz - Pós-doutorado (CNPq), na Universidade de Sydney (Austrália), em colaboração com o Dr.  Michael B. Thompson e Dr. Christopher R. Murphy.BRAZ HB; ALMEIDA-SANTOS SM; MURPHY CR; THOMPSON MB.  Uterine and eggshell modifications associated with the evolution of viviparity in South American water snakes (Helicops). Journal of Experimental Zoology Part B: Molecular and Developmental Evolution, v. 18, p. 1-16, 2018.

Alunos atuais

Supervisão de Pós-Doutorado

Serena Migliore Estratégias reprodutivas do mabuia-de-noronha Trachylepis atlantica do Arquipélago de Fernando de Noronha: implicações para a conservação.

Orientações de Mestrado

• Ximena López Goñi. Ciclos reproductivos de Geophis brachycephalus y Geophis godmani en Las Nubes de Coronado, Costa Rica. Início: 2025. Dissertação (Mestrado profissional em Programa de Posgrados en Biología) - Universidad de Costa Rica.
• Isabela da Silva Pereira. Avaliação de hemoparasitas e dosagem de hormônios esteroidais sexuais em jiboias (Boa constrictor) criadas em regime semiextensivo. Início: 2024. Dissertação (Mestrado em Patologia Experimental e Comparada) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. 
• Letícia Amante Contiero Sena. Avaliação ultrassonográfica gestacional de Crotalus durissus e Bothrops jararaca com ênfase na organogênese fetal. Início: 2024. Dissertação (Mestrado profissional em Anatomia) - Pós-graduação Anatomia dos animais domésticos e silvestres. 

Orientações de Doutorado

• Iago Vinícius de Sá Fortes Junqueira. Osteologia comparada do Gênero Lachesis Daudin, 1813 (Serpentes, Viperidae). Início: 2026. Tese (Doutorado em Anatomia dos animais domésticos e silvestres) - Faculdade de Medicina Veterinária e Zootecnia. 
• Sophia Menezes de Azevedo. Caracterização do viroma cloacal de cinco espécies de jararacas insulares. Início: 2026. Tese (Doutorado em Anatomia dos animais domésticos e silvestres) - Faculdade de Medicina Veterinária e Zootecnia. 
• Cybele Sabino Lisboa. Conservação ex situ da herpetofauna brasileira: caminhos para a recuperação de populações de espécies ameaçadas. Início: 2026. Tese (Doutorado em Anatomia dos animais domésticos e silvestres) - Faculdade de Medicina Veterinária e Zootecnia, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior.
• Érica da Silva Maciel. O papel da Ampola e do Segmento Sexual Renal em lagartos neotropicais. Início: 2024. Tese (Doutorado em Anatomia dos animais domésticos e silvestres) - Faculdade de Medicina Veterinária e Zootecnia, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. 
• Eletra de Souza. Ecologia do movimento de jararacas da Mata Atlântica. Início: 2022. Tese (Doutorado em Departamento Ecologia) - Instituto de Biociências USP, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. 
• Rebeca Stella Khouri. Biologia Reprodutiva de Scolecophidia Brasileiras: Revisão, novos dados e implicações evolutivas. Início: 2021. Tese (Doutorado em Zoologia) - Instituto de Biociências da Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. 
• Ligia Grazziely dos Santos Amorim. Estratégias reprodutivas de jararacas insulares endêmicas da costa Sudeste do Brasil. Início: 2021. Tese (Doutorado em Biodiversidade) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho. 
• Tyelli dos Santos Ramos. Influência do Hábito de Vida na Morfologia e Reprodução em Representantes da Família Elapidae (Squamata: Serpentes: Caenophidia). Início: 2021. Tese (Doutorado em Zoologia) - PPGZOO Museu Nacional - UFRJ.  

Orientação: Iniciação Científica

• Henrique Neres Macedo. Avaliação do sistema tegumentar das serpentes de ilha ex-situ. Início: 2026.  

Prêmios

• 2025: Prêmio de Jovem Cientista, modalidade: Especialização, XXIV Reunião Científica Anual Instituto Butantan, do aluno Juan Aquino Silva Juan Aquino Silva.
• 2021: Primeiro Lugar na Área de Biologia Animal 1 no 3^o Encontro dos Alunos de Iniciação Científica e Inovação Tecnológica, Instituto Butantan. Aluna: Gabrieli Santos de Araújo. Trabalho: Ciclo e comportamento reprodutivo de Chironius bicarinatus.
• 2021: Primeiro Lugar na Área de Biologia Animal 2, no 3^o Encontro dos Alunos de Iniciação Científica e Inovação Tecnológica, Instituto Butantan. Aluno: Renan Augusto Ramalho. Trabalho: Biologia reprodutiva de Ameiva ameiva.
• 2019: Melhor Trabalho em Morfologia Experimental - XVIII Simpósio Iberolatinoamericano de Terminologia Anatomica, Histológica, Embryologica/Congreso Regional de Morfologia. I International Congress on Anatomical Techniques/ I Jornada de la Asociación Panamericana de Anatomía. Aluna: Rafaela Zani Coeti. Trabalho: Sperm storage in coral snakes: a spermatozoa ultrastructure approach.
• 2019: Prêmio Jovem Cientista - Modalidade Doutorado, XXI Reunião Científica do Instituto Butantan. Artigo: : Facultative parthenogenesis in three neotropical pitviper species of the Bothrops atrox group. Sergio Cubides-Cubillos.
• 2013: Prêmio Jovem Cientista, Modalidade Doutorado, XV Reunião Científica Anual Instituto Butantan com a tese de Henrique Braz (Evolução da viviparidade nas serpentes da tribo Hydropsini).