A linha de pesquisa de Tiago Souza Salles concentra-se no estudo de vírus de importância em saúde pública, com ênfase em arbovírus, vírus respiratórios e vírus entéricos, integrando abordagens de virologia molecular, virologia celular e vigilância genômica para compreender a interação vírus-hospedeiro-vetor. Seus interesses incluem a investigação da diversidade viral em diferentes nichos ecológicos, utilizando estratégias de metagenômica para identificação de vírus emergentes e reemergentes, bem como a caracterização de novos vírus com potencial impacto epidemiológico. No contexto da virologia celular, sua pesquisa busca elucidar os mecanismos envolvidos na entrada, replicação e morfogênese viral, investigando como vírus modulam vias celulares para otimizar seu ciclo replicativo. Esses estudos permitem compreender etapas críticas da infecção e identificar potenciais alvos para intervenções antivirais. Em relação aos arbovírus, sua pesquisa abrange estudos de competência vetorial, transmissão vertical e dinâmica de infecção em mosquitos do gênero Aedes, buscando compreender os determinantes biológicos e ambientais que influenciam a manutenção e disseminação viral. Paralelamente, desenvolve investigações sobre vírus respiratórios e entéricos, com foco na caracterização molecular, diagnóstico e análise da circulação viral em populações humanas. Adicionalmente, sua atuação envolve o uso de ferramentas de sequenciamento de nova geração (NGS), RT-qPCR e análises bioinformáticas para vigilância genômica e detecção de variantes virais, contribuindo para o entendimento da evolução viral, adaptação a novos hospedeiros e potenciais eventos de spillover. Essa abordagem integrada visa subsidiar estratégias de monitoramento, prevenção e controle de doenças infecciosas virais.

Os Arbovírus representam um dos maiores desafios atuais em saúde pública, especialmente em regiões tropicais. A dinâmica de transmissão desses vírus depende de uma complexa interação entre o patógeno, o vetor e o hospedeiro vertebrado. Estudos de vigilância genômica têm permitido compreender a diversidade viral, a emergência de novas variantes e os padrões de disseminação. A competência vetorial, definida como a capacidade do mosquito de adquirir, replicar e transmitir o vírus, é um fator determinante na epidemiologia dessas doenças. Além disso, a transmissão vertical em mosquitos pode atuar como mecanismo de manutenção viral em períodos interepidêmicos. A integração entre dados genômicos, entomológicos e epidemiológicos tem sido fundamental para o desenvolvimento de estratégias mais eficazes de vigilância e controle de arboviroses.

VASCONCELLOS, BRENDA MARTINS ; FRAGATA, MÁRCIA DE MATOS ; RIBEIRO, VICTOR GUIMARÃES ; DE SOUZA, DÉBORA LISBOA ; PANZENHAGEN, PEDRO ; CONTE JUNIOR, CARLOS ADAM ; ATELLA, GEORGIA CORRÊA ; SALLES, TIAGO SOUZA ; MOREIRA, MÔNICA FERREIRA . Arginine kinase 2 knockdown enhances deltamethrin sensitivity in Aedes aegypti. PESTICIDE BIOCHEMISTRY AND PHYSIOLOGY, v. 216, p. 106825, 2026.

CALDAS, LUCIO AYRES ; CARNEIRO, FABIANA AVILA ; MONTEIRO, FÁBIO LUÍS LIMA ; SALLES, TIAGO SOUZA ; GONÇALVES, NOEMIA RODRIGUES ; HIGA, LUIZA MENDONÇA ; MOREIRA, MONICA FERREIRA ; AZEVEDO, RENATA CAMPOS ; TANURI, AMILCAR ; DE SOUZA, WANDERLEY . A comparative analysis of virus-cell interactions for two early Brazilian SARS-CoV-2 variants. VIROLOGY, v. 617, p. 110822, 2026.

DOS SANTOS, MURILO MARCONI ; SALLES, TIAGO SOUZA ; DE CAMPOS, GABRIEL MONTENEGRO ; BRCKO, ISABELA CARVALHO ; LIMA, ALEX RANIERI JERÔNIMO ; SAMPAIO, SANDRA COCCUZZO ; ELIAS, MARIA CAROLINA ; GIOVANETTI, MARTA ; SLAVOV, SVETOSLAV NANEV . Acute Respiratory Infections (ARIs): Current Etiological Perspectives and Advances in Viral Metagenomics-A Review. Viruses-Basel, v. 17, p. 1554, 2025.

SALLES, TIAGO SOUZA; MARTINS-DUARTE, ERICA SANTOS ; MENESES, MARCELO DAMIÃO FERREIRA DE ; MOREIRA, MONICA FERREIRA ; FERREIRA, DAVIS FERNANDES ; AZEVEDO, RENATA CAMPOS ; DE SOUZA, WANDERLEY ; CALDAS, LUCIO AYRES . Temperature Interference on ZIKV and CHIKV Cycles in Mosquitoes and Mammalian Cells. PATHOGENS, v. 13, p. 814, 2024.

SALLES, T. S; CAVALCANTI, A. C. ; COSTA, F. B. ; DIAS, V. Z. ; SOUZA, L. M. ; MENESES, M. D. F. ; SILVA, J. A. S. ; AMARAL, C. D. ; FELIX, J. R. ; PEREIRA, D. A. ; BOATTO, S. ; GUIMARAES, M. A. A. M. ; FERREIRA, D. F. ; AZEVEDO, R. C. . Genomic surveillance of SARS-CoV-2 Spike gene by sanger sequencing. PLoS One, v. 17, p. e0262170, 2022.

Atuais

Victoria Mel Dussan Ângulo – Coorientação de Mestrado / Pós-Graduação de Bioinformatica - USP

Branda Martins Vasconcellos – Coorientação de Doutorado / Pós-Graduação de Bioquímica - UFRJ

Egressos

2017 - Daniela de Souza - Iniciação Científica

Programas Especiais / Projetos Especiais - Primeiros Projetos - Chamada de Propostas (2025) - 2o Ciclo (https://fapesp.br/17465) Em Análise

Patente

1. Correia, IC ; Moreira, M. F. ; Moreira, M. F. ; SALLES, T. S. ; MIGOWSKI, E. . DISPOSITIVO DE ARMADILHA PARA INSETO AEDES. 2017, Brasil. 
Patente: Privilégio de Inovação. Número do registro: BR1020170001458, título: "DISPOSITIVO DE ARMADILHA PARA INSETO AEDES" , Instituição de registro: INPI - Instituto Nacional da Propriedade Industrial. Depósito: 04/01/2017

Instituto de Microbiologia - Universidade Federal de Rio de Janeiro.

Instituto de Química - Universidade Federal de Rio de Janeiro.

Prêmios

2018 - Obtenção de biofámacos com atividade antiviral a partir do cultivo de microalgas: Menções Honrosas - SIAC CCMN, Universidade Federal do Rio de Janeiro. 

2017 - Diagnóstico do vírus da dengue rápido e de baixo custo (Melhor trabalho apresentado), I Simpósio de Virologia da Universidade Federal do Rio de Janeiro. 

Entrevistas

1. TS, SALLES; MIGOWSKI, E. ; Moreira, M. F. ; Correia, IC . SALUD: Innovadora trampa para mosquito. 2019. (Programa de rádio ou TV/Entrevista). 

2. SALLES, TIAGO S.; MIGOWSKI, E. ; CORREA, I. C. ; Moreira, M. F. . Brazilian Researchers Modernize Mosquito Traps. 2019. (Programa de rádio ou TV/Entrevista). 

3. SALLES, T. S; MIGOWSKI, E. ; CORREA, I. C. ; Moreira, M. F. . Watch: Brazilian researchers develop new mosquito trap. 2019. (Programa de rádio ou TV/Entrevista). 

4. SALLES, T. S.; MIGOWSKI, E. ; Moreira, M. F. ; Correia, IC . VOANEWS: Brazilian Researchers Modernize Mosquito Traps. 2019. (Programa de rádio ou TV/Entrevista). 

5. SALLES, T. S; MIGOWSKI, E. ; CORREA, I. C. ; Moreira, M. F. . New ways to battle transmission of mosquito-born viruses. 2019. (Programa de rádio ou TV/Entrevista). 

6. SALLES, T. S; MIGOWSKI, E. ; Moreira, M. F. ; CORREA, I. C. . HZ BRAZIL MOSQUITO TRAP. 2019. (Programa de rádio ou TV/Entrevista). 

7. SALLES, T. S; MIGOWSKI, E. ; Correia, IC ; Moreira, M. F. . Watch: Brazilian researchers develop new mosquito trap. 2019. (Programa de rádio ou TV/Entrevista). 

8. SALLES, T. S; MIGOWSKI, E. ; Moreira, M. F. ; CORREA, I. C. . Watch: Brazilian researchers develop new mosquito trap. 2019. (Programa de rádio ou TV/Entrevista). 

9. SALLES, T. S.; MIGOWSKI, E. ; CORREA, I. C. ; MOREIRA, M. F . Armadilha Aedes aegypti. 2019. (Programa de rádio ou TV/Entrevista). 

10. TS, SALLES; MIGOWSKI, E. ; CORREA, I. C. ; MOREIRA, M. F . Aedes na mira. 2019. (Programa de rádio ou TV/Entrevista).